Quantification de l'hétérogénéité et des déterminants de la transmission du virus Ebola à partir des chaînes de transmission observées lors de la 10e épidémie en RDC (2018-2020).
Contexte et objectifs
Le virus Ebola continuant de représenter une menace en RDC, il est essentiel de bien comprendre l’hétérogénéité de la transmission à partir de données de terrain primaires afin d’améliorer la surveillance, la recherche des contacts et le ciblage des interventions. Nous comblons ici cette lacune grâce à une étude observationnelle rétrospective portant sur la plus grande base de données connue de chaînes de transmission du virus Ebola reconstituées sur le plan épidémiologique, issues de la 10e épidémie en RDC (2018-2020), ainsi que sur des données de surveillance collectées de manière systématique. Nous avons décrit cet ensemble de données et les chaînes reconstituées, quantifié les principales distributions épidémiologiques, notamment la distribution des descendants, et caractérisé son paramètre de surdispersion, sa variation temporelle et ses principaux déterminants.
Notre rôle
Coordination
Partenaire
- Ministère de la santé, DRC
Méthodologie
Les données de surveillance du ministère de la Santé et de Médecins Sans Frontières ainsi que les ensembles de données ETC ont été harmonisées au sein d’une base de données unifiée sur la transmission, ce qui a permis de reconstituer les réseaux de transmission dirigés. Les chaînes de transmission sont caractérisées par leur taille, leur durée, leur profondeur et leur structure, et les liens épidémiologiques sont évalués en comparant les source d’infection connues aux sources inconnues et à l’aide de courbes épidémiques stratifiées. Les paramètres de transmission (μ, k) et leur variation temporelle sont estimés à l’aide de modèles bayésiens binomiaux négatifs, incluant des analyses stratifiées et par fenêtre glissante. Les déterminants de la transmission sont évalués à l’aide d’une régression bayésienne binomiale négative.
Résultats
Les données révèlent qu’une petite minorité de cas – environ 18 % – était à l’origine de 80 % de l’ensemble des infections. Or, ce phénomène de « super-propagation » s’est maintenu même pendant les périodes les plus violentes, ce qui suggère que l’épidémie n’était pas due à une anomalie biologique, mais à notre incapacité à repérer et à isoler les cas à temps. L’isolement, le suivi des contacts et la vaccination en anneau ont tous démontré leur efficacité pour réduire la transmission lorsqu’ils ont pu être mis en œuvre.
